腺病毒和慢病毒载体测序实验方案
一 实验目的: 搞清楚公司目前常用的几个腺病毒和慢病毒载体序列,进行空载体测序
二 实验方法;选取公司常用的腺病毒和慢病毒载体,比如慢病毒载体H201,Y201,H101,H104,Y007;腺病毒载体AOV001,AOV002和AOV003.
通过腺病毒和慢病毒转化感受态细胞stbl3,LB培养,LB平板挑选单克隆摇菌过夜,送菌液去测序。采用通用引物测序的方法,根据细胞平台主管黄老师提供的信息,腺病毒载体测序引物:pDC315F: acg tgg gta taa gag gcg;pDC315R: cga tgc tag acg atc cag;慢病毒载体测序引物CMV-F:CGCAAATGGGCGGTAGGCGTG;先测序一部分,在此基础上继续设计引物,测通
三 实验步骤
1 配置好LB液体培养基和LB固体培养基。
2按SOP的要求转化,把空载体转化进感受态细胞stbl3中 3 超净台中操作,在离心管中加入0μL不含抗生素的LB培养基,置于37℃摇床上,200rpm震荡培养45min;
4 超净台中操作,取100μL转化液涂布于含抗生素(如氨卞)的LB平板培养基,置于37℃孵箱,过夜培养。
5 按SOP得要求涂平板,挑菌和摇菌。
6 送菌液测序
7 通过测序获得载体一部分序列,继续设计引物,测通质粒
四 实验的问题:因为不知道载体的序列,不方便设计引物,增大测序的困难;先使用别人推荐的引物
五 预知的实验结果
测通慢病毒H201,Y201,H101,H104,Y007; 测通腺病毒AOV001,AOV002和AOV003