中国畜牧兽医2018,45(1):22—31 China Animal Husbandry&Veterinary Medicine doi:10.16431/j.cnki.1671—7236.2018.01.003 鹅新城疫病毒RT—LAMP可视化检测方法的建立 刘文俊 ,黄运茂 ,阳佑天 ,许丹宁 ,曹 楠 ,周德荣 ,田允波 (1.仲恺农业工程学院,广东省水禽健康养殖重点实验室,广州510225;2.佛山科学技术学院,佛山528000) 摘要:本研究拟建立一种能在基层实时、便捷诊断鹅新城疫病毒(goose Newcastle disease virus,GNDV)的检测 方法。根据GenBank中公布的GNDV F基因的高度同源保守序列设计特异性引物,并在反应体系中添加钙黄绿 素/氯化锰指示剂,建立可视化RT—LAMP检测方法。结果显示,建立的方法能特异地检测出GNDV及NDV La— sota疫苗株,而小鹅瘟病毒(GPV)、禽流感病毒(AIV)、鸭坦布苏病毒(DTMUV)等其他病毒均为阴性。所建立的 GNDV可视化RT LAMP检测方法对RNA的最低检测限为1O pg,反应过程不需PCR仪等复杂的仪器,50 min即 可完成反应,可经肉眼观察反应体系颜色判定结果。该方法特异性强、灵敏度高,且操作安全、简便、快捷,可满足 基层筛查GNDV的需求。 关键词:鹅新城疫病毒(GNDV);环介导等温扩增(LAMP);钙黄绿素 中图分类号:¥858.33 文献标识码:A 文章编号:1671-7236(2O18)01—0022 10 Establishment of RT LAMP Visual Detection Method for Goose Newcastle Disease Virus IAU Wenj un ,HUANG Yunmao ,YANG Youtian ,XU Danning ,CAO Nan , ZHOU Derong ,TIAN Yunbo (1.Key Laboratory of Waterfowl Healthy Breeding in Guangdong,Zhongkai University of Agriculture and Engineering,Guangzhou 510225,China;2.Foshan University,Foshan 528000,China) Abstract:This study was aimed to establish a Real—time and easy—to—diagnose method for the de— tection of goose Newcastle disease virus(GNDV)at the grassroots leve1.Based on the highly ho— mologous conserved sequence of GNDV F gene published in GenBank,specific primers were de— signed and the calcein/manganese chloride indicator was added to the reaction system to establish a visual RT—LAMP detection method.The results showed that the detection method could specif— ically detect GNDV and NDV Lasota vaccine strains.and other viruses such as GPV.AIV and DTMUV were negative.The minimum detection limit of RNA was 10 Pg.The reaction procedure did not require complex instruments such as PCR instrument,and the reaction was completed within 50 min.The results were observed by the naked eye.This method was specificity,high sensitivity,and safe operation,simple and fast,could meet the primary screening of GNDV. Key words:goose Newcastle disease virus(GNDV);loop mediated isothermal amplification (LAMP);calcein 新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)又 称亚洲鸡瘟病毒,属于副黏病毒科、腮腺炎病毒 属口 。水禽作为NDV的自然储存库,一度被认为 对该病毒有很强的抵抗力,即使强毒感染也不表现 任何症状。然而,自1997年辛朝安等 、王永坤 等 。 在江苏和广东等地区分离到对鹅具有高度致病 收稿日期:2017—06—13 基金项目:广东省科技计划(2017A020208069);广东省普通高校青年人才创新项目(20161076);广东大学生科技创新攀登计划专项 (pdjh2o16bo243) 作者简介:刘文俊(1988一),男,湖南衡阳人,博士,讲师,研究方向:动物微生物学与免疫学,E—mail:1wjhero123@126.corn *通信作者:田允波(1965一),男,江西上犹人,博士,教授,研究方向:动物营养生理与畜禽健康养殖,E—mail:tyunbo@126.corn 1期 刘文俊等:鹅新城疫病毒RT—LAMP可视化检测方法的建立 23 性的毒株以来,该病毒不断在全国各地的鹅群中暴 发流行,造成巨大的经济损失,严重危害养鹅业的健 康发展。鹅新城疫(goose Newcastle disease,GND) 1材料与方法 1.1 材料 又被称为鹅副黏病毒病,是由基因Ⅶ型NDV引起 的一种以消化道病变为主要特征的急性、烈性传染 病,具有极高的发病率和死亡率 ]。常用的诊断方 法主要包括细胞培养分离病毒、RT—PCR等病原学 方法,以及HI/HA、酶联免疫吸附试验(ELISA)、 1.1.1 病毒及临床样品 GNDV、小鹅瘟病毒 (GPV)、H9亚型禽流感病毒(AIV)、鸭坦布苏病毒 (DTMUV)均由仲恺农业工程学院广东省水禽健康 养殖重点实验室分离保存;NDV Lasota弱毒活疫 苗购自广州永顺生物制药有限公司;25份鹅肝脏病 免疫荧光(IFA)等血清学、免疫学方法l_5]。由于鹅 新城疫病毒(goose Newcastle disease virus, GNDV)与其他基因型NDV毒株同源性差异较大, 以NDV基因为模板设计的分子生物学检测方法难 料样品于2015年10月至2016年8月采集于广东 省广州、阳江、汕头、清远等发生疫情的鹅场。 1.1.2 主要试剂及仪器dNTP、AMV反转录 酶、MiniBEST Viral RNA/DNA Extraetion Kit 以完全兼顾。此外,传统方法由于依赖实验室精密 仪器或部分方法在简便性、稳定性、经济性上有所不 足,了在实际生产中的应用_6]。 环介导等温核酸扩增技术(LAMP)是2000年 由Notomi等l7 开发的一种恒温核酸扩增方法。该 Ver 5.0、RRI、Ex Taq DNA聚合酶和琼脂糖均购 自TaKaRa公司;Bst DNA 3.0聚合酶购自NEB公 司;硫酸镁、甜菜碱(betaine)、氯化锰、钙黄绿素 (calcein)均购自Sigma公司。纯水仪购自ELAG 公司;手掌型离心机购自Scilogex公司;小型高速离 技术无需借助精密的仪器,具有简便、准确、廉价、高 灵敏度、高特异性的优点,非常适合临床应用_8 ]。 设计4条不同的特异性引物识别靶基因的6个特定 区域,通过一种链置换DNA聚合酶(Bst DNA pol— 心机购自Sigma公司;台式冷冻高速离心机购自 Thermo公司;高压灭菌锅购自江阴滨江医疗设备 公司;PCR扩增仪购自ABI公司;电泳仪购自Bio— Rad公司;凝胶图像分析系统购白天能公司;DK一8D ymerase)在等温条件下保温3O~60 min,即可完成 链置换扩增反应_7]。将该方法进一步与钙黄绿素体 系联用,实现可视化检测,可大大简化临床的鉴别诊 型电热恒温水槽购自上海森信实验仪器有限公司。 1.2方法 1.2.1 病毒RNA提取 抽提。 根据MiniBEST viral 断流程,使结果的观察和判定具有很强的直 观性[1013]。 RNA/DNA Extraction Kit Ver 5.0说明书进行RNA 本试验针对当前适用于GNDV的临床检测 方法缺失的现状,以GNDV F基因保守区为模 板,建立GNDV环介导等温核酸扩增(RT— LAMP)方法,并以基于钙黄绿素显色的结果为 判定标准,实现不开盖检测,减少开盖检测导致 1.2.2 引物设计与合成 运用Primer Premier 5.0软件,针对GNDV融合蛋白F基因(GenBank登 录号:KJ607167.1)的保守序列设计1对PCR引物 (P1和P2)。根据LAMP引物设计原理,应用在线引 物设计软件Primer Exporer 4.0针对GNDV F基因 假阳性的几率,以期建立一种适用于基层的检测 方法,能快速、简便、准确的检测出GNDV,以促 进该病的防控。 的保守区域序列进行LAMP引物设计。引物包括1 对外引物(F3和B3)、1对内引物(FIP和BIP),引物 信息见表1。引物均由生工生物工程(上海)股份有 限公司合成。 表1 GNDV RT-LAMP引物序列 Table 1 Primer sequences for GNDV RT-LAMP 引物名称Primers name P1 引物序列Primer sequences(5 一3 ) ATGGGCTCCAGACCTTC P2 F3 TCACATTTTTGTAGTGGCTC GATGACAACATGTAGATGTGTA CCCAAGCTCAGTTGAGAT B3 FIP BIP CCGCCTAAGGATAAAACATTGCATGGGTATCATATCGCAAAACTATGG ATAACTTTAAGGCTCAGTGGGGAATTGCCTGTTATTATTACTTGAGAA 24 中 国畜牧兽医 45卷 1.2.3 GNDV RT-LAMP扩增条件的优化 效果得出GNDV RT-LAMP反应的最佳Mg抖浓度。 分别按0.4、0.6、0.8、1.0、1.2、1.4、1.6 mmol/L 7个 dNTP浓度梯度进行RT—LAMP反应,以优化的条 件和成分,根据扩增效果得出GNDV RT—LAMP反 1.2.3.1 钙黄绿素可视化GNDV RT-LAMP检测 方法的建立 以GNDv基因组RNA为模板进行 RT—LAMP反应。反应体系25 L:10×Isothermal Amplification Buffer II 2.5 uL,dNTP(2.5 rnmol/L) 应的最佳dNTP浓度。按照表2进行8组不同内引 物与外引物浓度比例的RT-LAMP反应,以优化引 物的浓度和比例,根据扩增效果得出GNDV RT— LAMP反应的最佳引物浓度。分别按0、0.2、0.4、 0.6、0.8、1.0、1.2、1.4 mmol/L 8个甜菜碱浓度梯 3.5 L,甜菜碱(10 mol/L)2.0 L,FIP+BIP (10 umol/L)2.0 uL,F3十B3(10 umol/L)0.25 uL, 硫酸镁(100 retool/L)1.5肚L,钙黄绿素(25O ̄mol/L) 5 L,氯化锰(25 mmol/L)0.8 L,Bst DNA聚合酶 (8 u/ L)1.0 L,AMV反转录酶(5 U/uL) 度进行RT—LAMP反应,以优化的条件和成分,根 0.5 L,模板RNA 1.0 L,加灭菌DEPC水至 25 L。在65℃反应1 h后观察变色情况,每个反 应至少重复3次。 1.2.3.2 GNDV RT—LAMP反应体系优化 分 别在1、2、3、4、5、6、7、8 mmol/L 8个Mg抖浓度梯 据扩增效果得出GNDV RT—LAMP反应的最佳甜 菜碱浓度。分别按0、0.08、0.16、0.24、0.32、0.40、 0.48 U/uL 7个Bst DNA聚合酶浓度梯度进行 RT—LAMP反应,以优化的条件和成分,根据扩增效 果得出GNDV RT—LAMP反应的最佳Bst DNA聚 合酶浓度。 度进行RT—LAMP反应,其他成分不变,根据扩增 表2 内外引物浓度比例 Table 2 Concentration ratio of inside and outside primers 4 8 3 O.5 6:1 4 O.5 5 O.5 6 O.5 FIP+BIP F3+B3 2 1 3 1 3:1 2 O.5 4:1 比例Ratio 2:1 8:1 10:1 12:1 1.2.3.3 GNDV RT-LAMP反应条件优化 设置 (100 ng/uL)反转录为cDNA作为初始模板,将初 始模板进行1O倍梯度稀释(10 至10 ),P1、P2 作为上、下游引物进行PCR。PCR反应体系25 L: 1O×PCR Buffer 2.5/,L,dNTPs(2.5 mmo1)2 uL, 55、57、60、62、65、67℃6个温度梯度,在已优化的最 佳反应体系下进行RT-LAMP反应,根据扩增效果确 定最佳反应温度。分别设计1O、2O、3O、4O、5O、60、70、 8O min 8个时间梯度,在已优化的最佳反应体系下进 P1、P2(10 umol/L)各0.5 L,Ex Taq(5 U/uL) 行RT-LAMP,根据扩增效果确定最佳反应条件。 0.25 L,模板2 L,ddH2O补至25 L。PCR反应条 件:95℃预变性3 min;95℃变性30 S,59℃退火 30 S,72℃延伸9O S,共3O个循环;72℃延伸10 min 产物进行2.0 9/5琼脂糖凝胶检测。 l-2.4钙黄绿素可视化GNDV RT—LAMP方法的 特异性分析 以DTMUV、H9亚型AIV基因组 RNA及GPV基因组DNA为模板作为特异性对 照,按优化的条件,检测该方法的特异性,同时以 NDV Lasota株基因组RNA、GNDV为阳性对照, 1.2.7临床样品检测 将疑似感染GNDV的阳 性样品,提取RNA并反转录的模板作为模板,以P1、 P2为引物进行PCR反应。PCR反应体系25 L: 1OXPCRBuffer 2.5 L,dNTPs(2.5 mmo1)2 L,P1、 每个反应至少重复3次,反应结束后取5 L反应产 物进行2.0 琼脂糖凝胶电泳检测。 1.2.5 钙黄绿素可视化GNDV RT—LAMP方法的 P2(10 umol/L)各0.5肚L,Ex Taq(5 U/uL) 0.25 L,模板2 L,ddH2 O补至25 L。PCR反应 灵敏度分析 抽提GNDV的RNA模板并制备 出GNDV标准品(100 ng//zL)作为初始模板,将初 始模板进行1o倍梯度稀释(10 至10 ),按优化 的条件进行反应。反应结果用2.0 琼脂糖凝胶电 条件:95℃预变性3 rain;95℃变性30 S,59℃退 火3O S,72℃延伸90 S,共3O个循环;72℃延伸 10 min。同时以最佳的反应体系和反应时间在65℃ 进行LAMP反应50 min,通过反应变色情况,判定反 泳进行检测。 1.2.6 GNDV RT—PCR检测方法灵敏度分析 应结果。将PCR反应结果与RT-LAMP钙黄绿素可 提取GNDV的RNA模板并制备出GNDV标准品 视化检测方法的结果进行比较,计算符合率。 1期 刘文俊等:鹅新城疫病毒RT—I AMP可视化检测方法的建立 25 图2~7可知,最佳反应体系为:AMV 5 u/ I , 2 结 果 2.1 RT-LAMP GNDV检测方法的建立 1×Isothermal Amplification Buffer II,dNTP 1.4 mmol/I ,甜菜碱1.2 mol/I ,BIP和FIP均为 1.2 mol/I ,B3和F3均为0.2 mol/I ,钙黄绿素 50 umol/I ,MnC12 0.8 retool/I ,MgSO4 4 mmol/L 以GNDV RNA为模板进行RT-LAMP反应, 反应体系中添加钙黄绿素显色体系,通过变色进行检 测,验证检测方法的可行性。钙黄绿素法结果显示加 (共6 mmol/L),Bst DNA聚合酶0.24 u/ L,模板 入GNDV阳性模板的反应体系出现荧光绿色结果, 而空白对照为橘黄色(图1)。结果表明,建立的钙黄 RNA 100 ng// ̄L。在反应条件优化试验中,在55、 57、60、62、65和67℃6个不同温度间进行RT— 绿素可视化RT.LAMP GNDV检测方法可行。 LAMP反应,结果显示,65℃扩增条带最亮,梯形条 带分离清晰,目测阳性和阴性变色区别明显(图8)。 因此,选择65℃为LAMP反应的最佳反应温度;反 应时间优化结果显示,从3O min时开始即可通过琼 脂糖凝胶电泳检测到RT—I AMP扩增产物,反应 50 min后产物量趋于饱和(图9),因此,选定50 min 为GNDV RT—I AMP的最佳反应时间。 2.3 GNDV RT—LAMP检测方法特异性分析 为确认GNDV RT~LAMP检测方法的特异 +,阳性样品(呈绿色);一,阴性样品(呈黄色) +,Positive sample(green);一,Negative sample (yellow) 性,用优化的条件,以DTMUV、H9亚型AIV、 GNDV和NDA Lasota株基因组RNA及GPV基 7 5 2 ● ∞ ∞的∞ 的 ∞ 图1 GNDV R ̄LAMP检测方法的建立 Fig.1 Establishment of GNDV RT-LAMP detection method 因组DNA为模板进行LAMP方法检测。结果表 明,GNDV和NDV Lasota株为阳性,其余病原均 为阴性(图9),表明所建立的GNDV RT—LAMP 检测方法具有良好的特异性。 2.2 RT-LAMP扩增条件的优化 对镁离子、甜菜碱、dNTP、Bst DNA聚合酶及 内外引物的比例进行优化,优化结果见图2~7。由 M l 2 3 4 5 6 7 8 1 2 3 4 5 6 7 8 A B ①A。钙黄绿素法显色结果;B,凝胶电泳检测结果 图3~8同。②M,DL2000 DNA Marker;1~8。MgSO{浓度依次 为1、2、3、4、5、6、7、8 mmol/I ①A.Caleein assay results;B,Gel electrophoresis detection result.The same as tables 3 tO 8.②M.DI 2000 DNA Marker;1-8,Concentrations of MgSO4 were l,2,3,4,5.6,7 and 8 mmol/L,respectively 图2 Mgs()4浓度的优化 Fig.2 Optimization of M[gS04 concentration 26 中 围畜牧 兽医 M bp l 2 3 4 5 6 7 15卷 2000 1000 1 2 3 4 5 6 7 750 500 250 i00 A B M,DI 2000 I)NA Marker;l~7.dNTP浓度依次为0.4、0.6、0.8、1.0、1.2、1.4、1.6 mmoI/I M.DI 2000 DNA Marker;1 7.Concentrations of dN FP were().4.0.6.().8.1.(】.1.2.1. I and 1.6 retool/I -respectiv ̄、ly 图3 dNTP浓度的优化 Fig.3 Optimization of dNTP concentration M bp l 2 3 4 5 6 7 8 2000 1000 750 500 l 2 3 4 5 6 7 8 250 100 A B M,I)I 2000 1)NA Marker;1~8,内外引物浓度比依次为1:1、2:1、3:1、4:1、6:1、8:1、l0:1、l2:1 M.I)I 2000 DNA Marker;l一8。The ratios of outer and inner primers were l:1,2:1.3:l_4:1-6:1·8:1,l0:1 and 1 2:1.respectively 图4 内外引物浓度比例的优化 Fig.4 Optimization of ratio of outer and inner primers M l 2 3 4 5 6 7 bp 2000 1000 2 3 4 5 6 7 750 500 250 i00 A B I6、0.24、0.32、0.40、0.48 U/td M。I)I 2000 DNA Marker;1~7,酶的浓度依次为0、0.08、0. polymerase were 0.0.08.0.16,0.24.0.32,0.40 and M.DI 2000 DNA Marker;1 7.【、0ncentr rltion Of Bst DNA 0.48 U Iii .respectively 图5 Bst DNA聚合酶浓度的优化 Fig.5 Optimization of Bst DNA polymerase concentration l期 刘文俊等:鹅新城疫病毒R2 I AMt’叮视化检测方法的建立 27 l — 5 + ~ + 一 + + ~ + 6 ! —· 曼 上—— + A 圈 4 5 —= 6 —= 7 —= 8 J一 —: bp 2000 1000 750 500 25O 1O0 B ①+,阳性样品;一。阴性样品。图7、8同。②M。DI 2000 DNA Marker;1~8,甜菜碱的浓度依次为0、0.2、0.4、0.8、 l_0、1.2、1.4 mol/I ①+.Positive sample.一,Negative sample.②M.DI 2000 DNA Marker;l_8。Concentrations of betaine were 0,0.2, 0.4,0.8,l_0,1.2 and 1.4 mol/1 .respectively 图6甜菜碱浓度的优化 Fig.6 Optimization of betaine concentration 1 2 3 4 5 + 一 + 6 A M士bp 2000 士士 a 6 1000 750 500 250 10O B M.DL2000 DNA Marker;l~6,55、57、6O、62、65、67℃ 图7 GNDV RT-LAMP反应温度的优化 Fig.7 Optimization of reaction temperature of GNDV RT-LAMP 28 中 国 畜牧兽医 l 2 3 4 5 6 7 8 F——一二 —_ —_ —_ —__干—_ —— 加 加7 5 2 ∞∞趵∞ ∞ ∞ m 7 5 2 1 ∞ ∞∞∞ ∞ ∞ 士 士 士 A 圈 M.I)【 2O00 DNA Marker;1~8.10、20、30、40、50、6O、70、8O rain 图8 GNDV RT-LAMP反应时间的优化 Fig.8 Optimization of reaction time of GNDV RT-LAMP 士 士 RT—PCR检测方法检测的阳性样品为7份,阳性率 为28%。应用RT—I AMP方法检测的阳性样品为 8份,阳性率为32 9/6。两种方法的符合牢为96 (表3)。 3 讨 论 ND是一种禽烈性传染病。最早发现于1926 年。该病在世界范围内肆虐传播,在禽流感出现以 前,曾是养禽业的头号疾病 。其宿主范围极大. M,DI 2000 DNA Marker;1~5,(;NI)V、NDV I asota、H9 亚型AIV、( PV、DTMUV M.DI 2000 DNA Marker;1—5.GNDV,NDV I asOta. H9 subtype AlV,GI V and I)TMUV,respectively 除鸡、鸽、孔雀、鹅等250多种鸟类外,还有感染猪 的报道,由此可预见,未来ND的防控局而仍然严 峻_】 。水禽养殖业是农业产业的重要组成部分, 图9 GNDV RT-I AMP检测方法特异性分析 Fig.9 Specificity of GDNV RT·I AMP detection method 以广东地区为例:鸭年均饲养量2.5亿只,鹅年均 饲养量7 000万只¨引。目前,GND严重危害养水 禽业的健康发展,造成的损失仅次于人IV。此外. 2.4 GNDV RT—I AMP检测方法灵敏度分析 对GNDV基因组RNA进行10倍梯度稀释试 验表明,钙黄绿素可视化RT I AMP检测方法与 RT-I AMP琼脂糖凝胶电泳检测方法灵敏度一致,最 低检测限度为1O pg比RT-PCR检测方法的100 Pg 灵敏度高10倍(图10)。 2.5 GNDV RT—LAMP检测方法的临床应用研究 由于水禽是NDV的天然储存宿主,一些中低毒力 毒株在传播过程中,可能会基凶突变.毒力不断加 强。只有清除了水禽NDV,才能彻底的消灭该疾 病的威胁。由于GNDV与NDV其他基因型毒株 同源性较差,传统NDV疫苗和诊断方法的使用效 果较差,而针对性的疫苗和检测方法研发进展 缓慢 ”j。 将临床研究采集的25份疑似病料进行RT— PCR和RT—I.AMP方法检测。由表3可知,应用 1期 刘文俊等:鹅新城疫病毒RT I AMI r,J.挑化检测 法的建曲 29 M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 M l 2 3 4 5 6 7 8 9 m 7 5 2 ∞∞∞∞的∞ 0~ A 一≈ 2 3 4 ≮ 5 6 7 8 B 9 警 霉 蘸 0 一 墨 7 5 2 ● 。 C ①A.RT PCR检测方法;B,RT I AMP检测方法;c.钙黄绿素町视化RT—LAMI 检测方法。②M,DI 2000 DNA ∞ ∞舳∞ ∞ ∞ Marker;1~8,稀释度分别为10 至10 ;9,阴性对照 ①A.RT—PCR detection method;B,RT I AMP detection method;L’,R F—I AMP combined with calcein detection 罄 ■ metlmd.(2)M,DI 2000 DNA Marker;1 8.Dilution of RNA was 10 10 10 ;9,Negat1ve control 图10 GNDV RT—LAMP检测方法灵敏度分析 Fig.10 Sensitivity of GNDV RT-LAMP detection method 表3 GNDV RT-I AMP检测方法的临床应用 Table 3 Clinical application of GNDV RT-LAMP 一 好、灵敏度高的特点,灵敏度是普通PCR的10~ 1()()倍。最重要的是反应十分迅速,在60 min之内 即可完成试验。目前,已有多种疾病I AMP诊断方 法建 的报道l】 。 虽然之前已经有NDV I AMP检测方法建立的 报道ln I,但I AMP引物设计复杂,难以在一个短的 区间内对NDV和GNDV进行准确的鉴别诊断,以 禽养殖场一般地处偏远,实验室大型检测仪器 不方便携带,常用PCR、实时荧光定量PCR等分子 生物学诊断方法基本不能在现场使用。疾病发生 后,往往只能依靠剖检病禽,观察病理损伤来诊断疾 NDV为模板建立的检测方法,在GNDV的检测中 难免出现以偏概全和漏检的情况。此外,水禽是 NDV的储存库,开发一种以GNDV为模板的能兼 顾其他基因型NDV的检测方法有更大的应用前 病。即使在实验室中,传统分子生物学诊断方法虽 然准确,但也有耗时较长的缺点。而El ISA检测试 剂盒价格较贵,且部分产品的稳定性较差,假阳性、 景。本试验比对了GenBank上已发布的毒株,选择 厂6个相对保守的区间,以GNDV毒株为模板设计 通用引物,使之理论上能检测各种基因型的NDV。 假阴性的情况十分突出。病原的分离鉴定,实际操 作起来费时费力,难以应付突发的疾病。因此,建立 一为_r降低漏检率,没有增加设计环引物来提高反应 速率。研究通过测试多对引物,使总体反应时间控 种简单、快速、准确、高效、且特异性好、灵敏度高、 的迫切需求。I AMP是一种理想的诊断方法。该 制在50 min结束,以满足快速检测的需求。研究表 明,RT—I AMP的反应条件和体系直接影响了检测 的特异性和敏感度,如内外引物的浓度、Mg。一浓度 可在临床使用的检测方法是当前兽医临床疾病诊断 方法简便易行,无需复杂的仪器,仅需一个水浴锅或 一及酶浓度等。因此,本试验对建立的GNDV RT— I.AMP检测方法进行体系和条件的优化。另外,在 个温度计和保温瓶即可进行。该方法具有特异性 30 中 国 畜 牧 瞥 医 1 5巷 临床样本的检测中,LAMP检测方法与PeR检测 方法的检出率符合率达96 ,说明建立的检测方法 稳定町靠、特异性强、敏感度高。 本研究建立的钙黄绿素可视化GNDV RT LAMP快速检测方法,只需在水浴锅中恒温65℃ 反应50 rain,通过肉眼辨别反成产物的颜色即可判 定结果。相较于观察白色沉淀判定反应结果的方 法,该方法更直观、准确且尤特殊设备的要求。检测 过程无需开盖,很大程度地避免了污染的可能。目 前NDV国标的检测方法是RT—PeR检测法,PCR 反应时问为62。5 min。加上琼脂糖凝胶电泳的时 间,总时间超过90 min。本方法较之节约了一半的 反应时间.疗法灵敏度也有较大提高。 4 结 论 本试验建立的钙黄绿素可视化GNDV RT— I.AMP检测方法,可用于禽类NDV流行情况的初 步筛查、进出口贸易中NDV的快速检测及水禽中 NDV的净化,该方法稳定、高效具有良好的应用 前景。 参考文献(References): [1] 殷震,刘景华.动物病毒学[M].第2版.北京:科 学出版社,l997. 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