法律分析：
不予起诉的案件，机关应当改变强制措施，或者进行补充侦查，机关认为不起诉的决定有错误的时候，可以要求复议，如果意见不被接受，可以向上一级人民提请复核。
不起诉不会留有案底。案底又称犯罪人员犯罪记录制度，在我国法律中一般指有过刑事犯罪前科的档案记录，而该犯罪档案一般存放至门与相关国家机关。人民依法审判，判处有罪的，才会有案底，不起诉也就不会被判决，自然不会有案底。
法律依据：
《中华人民共和国刑事诉讼法》
第一百七十九条 对于机关移送起诉的案件，人民决定不起诉的，应当将不起诉决定书送达机关。机关认为不起诉的决定有错误的时候，可以要求复议，如果意见不被接受，可以向上一级人民提请复核。
第一百八十条 对于有被害人的案件，决定不起诉的，人民应当将不起诉决定书送达被害人。被害人如果不服，可以自收到决定书后七日以内向上一级人民申诉，请求提起公诉。人民应当将复查决定告知被害人。对人民维持不起诉决定的，被害人可以向人民起诉。被害人也可以不经申诉，直接向人民起诉。人民受理案件后，人民应当将有关案件材料移送人民。
