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酶切及连接问题

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前一周我刚刚做过单酶切连接,目的片段(pKB-2为克隆载体)4600多,载体pART27,11500,连接比例3:1,昨天刚刚鉴定出来阳性克隆,阳性克隆占30%。

步骤如下:

○1.前一天晚上用NoTI酶切pART27,用100μL的体系。体系如下:

质粒30μl

10×buffer 10μl

0.1%BSA10μl

0.1%TritonX-100 10μl

灭菌水 38μl

NoTI 2μl

○2.回收酶切产物,步骤如下:

1. 加等体积的苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提一次。加溶液后上下颠倒混匀,冰上放置5min.12000,离心5min。

2. 吸取上清,尽量不要吸到有机相,加二倍体积的无水乙醇(提前在-20度预冷)沉淀DNA. 加溶液后上下颠倒混匀,冰上放置5min.12000,离心5min。

3. 倒去乙醇,然后加70%的乙醇洗涤沉淀,上下颠倒5次,静止1-2 min,弃上清,快速离心,吸干乙醇,平放无菌操作台,鼓风吹15 min。

4. 吹干后,加20μlTE溶解.

○3回收产物去磷酸化,体系如下:

DNA Framgents in TE buffer 20μl

10×Alcaline phosphatase buffer 5μl

CLAP 1μl

灭菌水 24μl

PS: NoTI是5′突出端,所以选用37度30 min反应。

○4.回收去磷酸产物,步骤如下:

1. 加等体积的苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提一次。加溶液后上下颠倒混匀,冰上放置5min.12000,离心5min。(注:酶切说明书要求抽提二次,但考虑损失太多,故舍去一次。)

2. 加等体积的氯仿:异戊醇(24:1)抽提一次。加溶液后上下颠倒混匀,冰上放置5min.12000,离心5min。

3. 添加5μl3MNaoAC。

4. 紧接着加125μl(2.5倍)冷乙醇,加完后上下颠倒混匀在-20℃下保冷30-60 min,12000,离心5min。

5. 用200μl的70%冷乙醇洗涤沉淀,上下颠倒5次,静止1-2 min,弃上清,快速离心,吸干乙醇,平放无菌操作台,鼓风吹15 min。

6. 吹干后,加10μlTE溶解.

○5.12:00,用NoTI酶切pKB-2,同时制1%胶,采用100μL的体系(同pART27酶切)。

○6.15:00,电泳pKB-2片段同时检测pART27片段。

○7.胶回收pKB-2片段回收步骤如下:

1. 加350μL的binding buffer,55℃条件下,水浴10 min,期间上下颠倒5次。

2. 室温下放置1 min,8000r/min,离心1min。

3. 倒去溶胶,加入500μL的Washing buffer,8000r/min,离心1min。

4. 重复步骤3.

5. 倒去溶液,快速离心15S。

6. 加10μL Elution buffer溶解。

○8.17:00 ,做连接,连接体系如下:

连接buffer 5μL

pKB-2回收片段 3μL

pART27片段 1μL

连接酶 1μL

16度连接一个半小时,放入4度。

○9.做感受态,步骤如下:

1. 吸取二次活化的菌液1.5ML,快速离心30S,收集菌体。

2. 取预冷的0.1M的CaCI2200μL,重悬菌体。冰上放置25 min。

3. 快速离心30S,重新收集菌体。

4. 加入0.1M的CaCI275μL,重悬菌体,放入4度备用。

○10.转化,

1. 吸取连接产物,加入到150μL的感受态细胞中,冰上放置30分钟。

2. 42℃循环水浴中热激90S,迅速冰浴2min.

3. 加入600μLLB,37度振荡培养45 min。

4. 4000r/min离心10 min,弃450μL上清,

5. 悬沉淀,用100μL铺平板。

6. 37度培养12-24H。

希望对你有所帮助,如果还有问题的话,继续探讨

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