法律分析：领导扣除员工奖金是否违法，要按照实际情况来定，具体如下：1、劳动者在劳动关系中处于弱势，怕提出离职企业不发年终奖，迟迟不敢离职。也有企业规定，一旦离职，不发年终奖。企业规定员工辞职不发年终奖的做法是违法，可以向提起民事诉讼；2、但是如果员工由于违规，导致领导扣除奖金的，那句不违法。
法律依据：《中华人民共和国民事诉讼法》
第一百一十九条 起诉必须符合下列条件：
（一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；
（二）有明确的被告；
（三）有具体的诉讼请求和事实、理由；
（四）属于人民受理民事诉讼的范围和受诉人民管辖。
