法律分析：
刑事案件证据不足事实不清一般情况下会不予起诉。
1、法定不起诉。
根据《刑事诉讼法》，其适用条件为：情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的;犯罪已过追诉时效期限的;经特赦令免除刑罚的;依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的;犯罪嫌疑人、被告人死亡的;其他法律规定免予追究刑事责任的。
2、酌定不起诉。
由《刑事诉讼法》规定：“对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民可以作出不起诉决定。”
3、存疑不起诉。
由《刑事诉讼法》规定：“对于补充侦查的案件，人民仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉的决定。”
法律依据：
《中华人民共和国刑事诉讼法》 第一百七十一条第四款 因事实不清，证据不足不予起诉。对于二次补充侦查的案件，人民仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。
