员工自己申请工伤认定单位极不配合的，员工可以与单位协商，要求其配合；并依法向社保行政部门提交申请所需的材料。根据受伤害职工自行提供的证据或者调查取得的证据，社会保险行政部门一般应当自受理工伤认定申请之日起60日内作出工伤认定决定。
【法律依据】
《工伤认定办法》第十七条职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。用人单位未按前款规定提出工伤认定申请的，工伤职工或者其直系亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区劳动保障行政部门提出工伤认定申请。第二十条社会保险行政部门应当自受理工伤认定申请之日起60日内作出工伤认定的决定，并书面通知申请工伤认定的职工或者其近亲属和该职工所在单位。
