三年不同居的离婚方式有：
1、可以协议离婚，双方亲自到一方户口所在地婚姻登记管理机关申请离婚登记，婚姻登记机关审核通过后发放离婚证，当事人取得离婚证后，解除夫妻关系；
2、也可以走诉讼离婚，写离婚起诉书，准备诉讼离婚所需的证据，向有管辖权的提交离婚诉讼和证据，等待审判。
夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民法典》
第一千零七十六条 夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。
