1、强奸罪的认定就是违背妇女意志，应当围绕这个问题寻找证据，因为案情不一样，证据也不一样;
2、主要有：
(1)被害人身体内或内裤上残留的嫌疑人精液;
(2)被害人的现场遗留物;
(3)被害人陈述、被告人辩解和证人证言。
一、受到强奸怎么办？
应及时报案，留存好相关证据，合法维护自己的权益。证据包括：物证；书证；证人证言；被害人陈述；犯罪嫌疑人、被告人供述和辩解；鉴定意见；勘验、检查、辨认、侦查实验等笔录；视听资料、电子数据。证据必须经过查证属实，才能作为定案的根据。强奸罪，以暴力、胁迫或者其他手段强奸妇女的，处三年以上十年以下有期徒刑。奸淫不满十四周岁的幼女的，以强奸论，从重处罚。
二、被害人陈述的质证由哪个部门认定
被害人陈述的审查和判断由司法机关来进行认定处理，被害人陈述是刑事诉讼法上的一种证据种类，被害人陈述对揭露犯罪、查获犯罪人、认定案情有重要作用，是司法机关查明和认定案情的一种重要证据。这是因为被害人一般对犯罪嫌疑人、被告人的犯罪经过、体貌特征和自己的受害时间、地点、经过等具体的案件事实有比较清楚的了解，因此被害人具有特殊的诉讼地位，《刑事诉讼法》将被害人陈述确定为一种的证据种类。另外，被害人陈述的证据效力是有限的，被害人陈述不能单独作为定案的依据，其证据效力是有限的。被害人陈述如果有其他证据相印证，查证属实，则可以作为定案的重要证据，如果不能和其他证据相印证，就不能单独作为定案的依据。
这是因为被害人受到犯罪行为的侵害，是案件的直接受害者，被害人有可能出于对犯罪嫌疑人和被告人的憎恨、出于某种不良动机或其他种种原因，在向司法机关供述时，夸大其辞，避轻就重，甚至故意捏造事实，谎报案情，也可能因突然遭受犯罪行为的侵害，精神高度紧张、激动，而发生认识上、记忆上的错误。所以对被害人陈述不能不信，也不能轻信，要客观地、实事求是地审查它的真伪。
三、新刑诉法证据种类有哪些？
刑诉法规定的证据种类主要有：
1、物证、书证；
2、证人证言；
3、被害人陈述；
4、犯罪嫌疑人、被告人供述和辩解；
5、鉴定意见；
6、勘验、检查、辨认、侦查实验等笔录；
7、视听资料、电子数据等。
