法律分析：员工在公司犯罪中，其刑事责任应当根据所犯罪行的性质、情节和后果等因素来进行判定。
法律依据：
1.《中华人民共和国刑法》第二十二条规定：单位犯罪，由单位承担刑事责任；
2.《中华人民共和国刑法》第二十三条规定：单位犯罪，应当对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照其责任大小分别给予处罚；
3.《中华人民共和国刑法》第七十七条规定：单位犯罪罚金数额的确定，应当根据单位的违法所得和情节严重程度等因素决定；
4.《中华人民共和国刑法》第七十规定：单位犯罪罚金的数额，不得超过单位违法所得的三倍；
5.《中华人民共和国刑法》第七十九条规定：单位犯罪，可以并处剥夺政治权利、没收财产等附加刑罚。
根据以上法律规定，员工在公司犯罪中，若为单位犯罪，则单位应当承担刑事责任；而对于直接负责的主管人员和其他直接责任人员，则应当依据其责任大小分别给予处罚。此外，单位应当按照其违法所得和情节严重程度等因素来确定罚金数额，但罚金数额不得超过单位违法所得的三倍，并可并处剥夺政治权利、没收财产等附加刑罚。
