可可西里自然保护区位于青海西南部的玉树藏族自治州境内。它是横跨青海、、三省区之间的一块高山台地。保护区西与相接，南同格尔木唐古拉乡毗邻，北和维吾尔自治区相连，东至青藏公路，总面积4.5万平方公里。
青海可可西里国家级自然保护区因海拔高、气候干旱寒冷，形成了典型的高寒气候特征。在西金乌兰湖地区有一明显的相对暖区。年均温为-10.0℃～4.1℃，最低气温-46.2℃。分布趋势是由东南向西北逐渐降低。最冷月出现在1月份，最暖月在7月份。年均降水量在173～495mm之间，由东南向西北逐渐减少。降水主要集中在5～9月份，占年降水量的90%以上。可可西里地区由于受高空强劲西风动量下传的影响，成为整个青藏高原和全国风速主值区之一，年均风速分布由东南、东北向腹地及西部逐渐增大，等值线基本呈“喇叭口型”。风速在8.0～3.5m/s之间。
青海可可西里国家级自然保护区保护范围为：东至青藏公路，西至青海省界，北至昆仑山脉的博卡雷克塔克山，南至格尔木市唐古山乡与治多县界，东经.25°～94.05°，北纬34.19°～36.16°，总面积约4.5万平方公里;核心区为可可西里山与乌兰乌拉山——冬布勒山之间，面积1.55万平方公里。
青海可可西里国家级自然保护区现有高等植物约202种，分属30科102属。以矮小的草本和垫状植物为主，木本植物极少，仅存在个别种类，如匍匐水柏枝、垫状山岭麻黄。200多种植物中，青藏高原特有种和青藏高原至中亚高山、西喜马拉雅和东帕米尔分布的种在区系成分中占主导地位。并有一定数量的北极高山成分，而温带亚洲分布的种较少，温带和世界广布的种极其个别，仅出现在环境相对稳定的水域生境中，如海韭菜和眼子。据初步统计，该区青藏高原特有种有84种，约占该区全部植物的40%，其中青海可可西里地区特有种和变种约有8个以上。青藏高原至中亚高山、西喜马拉雅、东帕米尔分布的种50个左右，占该区植物的35%。北极-高山成分约有5种。
青海可可西里国家级自然保护区已知哺乳类动物有30种，隶属于5目12科20属;鸟类有56种，隶属10目22科。此外，本区产2种裂腹鱼类及4种鳅类，几乎全为高原特有种。爬行动物仅青海沙蜥1种。拥有野牦牛、藏羚羊、野驴、白唇鹿、棕熊等青藏高原上特有的野生动物。可可西里是中国动物资源比较丰富的地区之一，拥有的野生动物多达230多种。
由于该区地势高亢，气候干旱寒冷，植被类型简单，食物条件及隐蔽条件较差，动物组成简单。但是，除猛兽猛禽多单独营生外，有蹄类动物具结群活动或群聚栖居的习性，种群密度较大，数量较多。
