在农村宅基地确权登记过程中，下列12种情形下，农村宅基地是不予确权的：
1、宅基地不符合《乡镇土地利用总体规划》；
2、除继承和分居立户外，农户一户超过一处以上的；
3、非本集体经济组织成员或城镇居民在农村购买和建造的住宅；
4、土地权属有争议尚未处理结束的；
5、农村村（居）民因新建住宅，应当拆除而未拆除的旧宅或旧宅纳入土地置换项目规划，未复垦的；
6、空闲或房屋坍塌、拆除两年以上未恢复使用的；
7、因拆迁或原住宅依法被征收，已依法进行统一安置或补偿的；
8、土地违法违规行为尚未处理或正在处理的；
9、经批准后连续两年未使用的；
10、集体供养的五保户腾出的住宅；
11、因依法查封地上建筑物和其他附着物等原因限制土地权利的；
12、法律法规、政策规定的其他不予确权的情形。《土地管理法》第十四条土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。
【本文关联的相关法律依据】
《农村宅基地管理办法》第十七条农村村民申请宅基地，应当向常住户口所在地的村民委员会或村集体经济组织提出书面申请，经村民委员会或村集体经济组织讨论同意，并将申请宅基地户主名单、家庭人口、原有房屋间数面积、申请建房占地面积、位置等张榜公布后无异议的，取得乡村建设规划许可证或建设用地规划许可证后，报乡镇人民政府审查，县土地行政主管部门审核，由县人民政府批准，其批准结果由村民委员会予以公布。
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