员工迟到的，用人单位可以扣工资，但是不可以罚款，罚款是行政执法机关的权限。公司对于迟到员工的处罚不得超过当月工资的20%，另外扣发完工资后不得低于最低工资标准。
一、工作失职怎么处罚
员工因重大过失造成公司损失的，公司可要求其赔偿。因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。
经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
二、新劳动法关于员工罚款的规定
新劳动法对于员工罚款没有特别的新规定，对于犯错的员工，没有明确约定的，按照劳动法不能对员工进行处罚，因员工的过错造成公司产生巨大损失，用人单位可以要求赔偿，赔偿方式为用人单位可以从员工每月工资中扣除，但每月扣除的工资比例不超过20%。而且对于扣除之后的规定也有相关的，即若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
三、公司规定迟到一分钟5块是否合法
公司规定迟到一分钟扣5块合法，具体如下：
1、如果公司规章制度中有迟到罚款，公司规章制度是通过民主程序制度，即制定颁布程序是合法的，只要罚款金额不超过法律规定的必要限度，就是合法的；
2、迟到，属于缺勤，但缺勤时间短，迟到时间不工作，不支付报酬符合规定；
3、无正当理由迟到，因迟到造成用人单位经济损失的，劳动者还应当赔偿损失。法律对迟到工资的具体扣发没有明确规定，可以由用人单位制定。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国劳动合同法》第三十条规定：用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民申请支付令，人民应当依法发出支付令。
