专利入股合作支公司签订专利协议书流程如下：
1、签订转让合同；
2、到专利局办理登记手续，并由专利局公告，合同自登记之日起生效；
3、若专利申请人为两个或者两个以上的人，专利申请权的转让必须经全体权利人同意，中国单位或者个人向外国人转让专利申请权或者专利权的，必须经对外经济贸易主管部门会同科学技术行政部门批准。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国专利法》
第十二条 任何单位或者个人实施他人专利的，应当与专利权人订立实施许可合同，向专利权人支付专利使用费。被许可人无权允许合同规定以外的任何单位或者个人实施该专利。
