关于孕妇阶段能否进行合法的离婚程序，这需要根据具体情况来做出判断和决策。
首先，我们需要关注到，当女方正处于孕期，那么男方就不被允许通过法律手段要求离婚。
然而，若女方坚持要求离婚或是司法机关判定确实存在必须受理男方离婚请求的特殊情况，便可依法启动此项程序。
其次，如果女方已经怀有身孕，但作为现役军人的配偶身份而言，在面临离婚问题时，必须得到现役军人的明确同意，除非军人一方存在严重过失行为。
最后，对于女方在孕期的情况下，夫妻双方也可以选择通过法律途径解决婚姻问题，达成离婚协议。
【法律依据】
《民法典》第一千零八十二条，女方在怀孕期间、分娩后一年内或者终止妊娠后六个月内，男方不得提出离婚；但是，女方提出离婚或者人民认为确有必要受理男方离婚请求的除外。
